肉毒杆菌素注射不是没有副作用的，最多见的副作用是两边不对称或者注射部位的肌肉无力。副作用的发生与医师的经验，以及注射当时的剂量与注射的部位有关。肉毒杆菌素的注射结果也并非百分之百，少数人在几次的注射后，身体会出现对抗肉毒杆菌素的抗体，使得之后的注射无效。